它的原理是基于深度学习技术和计算机视觉,通过模拟物理原理来预测蛋白质的结构。它的模型是一个多层的神经网络,其中包含了一系列的卷积层,它们可以通过模拟蛋白...
结构预测 是指仅依据蛋白序列的信息来预测蛋白质每个原子在三维空间中的相对位置。(理论基础) 可以是从零开始的,尝试计算并最小化自由能,或得出一个合适的近...
第一步:寻找模板 - 寻找与目标蛋白具有相似序列和结构的已知模板,理想情况下,一致性应超过30%。序列比对 - 确保模板和目标蛋白的氨基酸序列匹配,这是构建准确...
首先确定它的一级结构,就是氨基酸序列;然后是二级到四级结构的推测。理论上可以用原子力显微镜,电子隧道扫描显微镜观测,最常用的应该是根据已知几种标准蛋白的...
通过统计分析,获得的每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子,进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级结构。 ②GOR方法:是一种基于信息论和贝叶斯统计学...
传统的观点认为,蛋白质的一级结构决定它的三维结构,也就决定了其功能。因此,常通过已知的蛋白质序列比对来预测未功能,或者是通过序列来预测蛋白质的一些功能。...
X晶体衍射。首先要得到蛋白质的晶体。通常,都是将表达蛋白的基因PCR之后克隆到一种表达载体中,然后在大肠杆菌中诱导表达,提纯之后摸索结晶条件,等拿到晶体之后...
二级结构预测 三级结构预测 同源建模:需要有同源的蛋白三级结构为基础进行预测。 Threading法。 “从头开始”...
【答案】:NMR在确定蛋白质三维结构的基本原理是对蛋白质溶液样品进行各种类型的同核或异核多维核磁共振实验,并由这些实验所提供的核磁共振波谱数据。
1、通过实验的方法预测蛋白质结构,即对蛋白质晶体使用X射线衍射或核磁共振,得到晶体电子密度等方面的信息,从而分析蛋白质结构。这是结构生物学的方法。该方法结...
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